“jModelTest is a tool to carry out statistical selection of best-fit models of nucleotide substitution. It implements five different model selection strategies: hierarchical and dynamical likelihood ratio tests (hLRT and dLRT), Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC), and a decision theory method (DT).”

Github del programa

Darreres versions del programa (…del 2016)

Manual en pdf de les darreres versions

Ells mateixos en el seu fòrum d'ajuda recomanen de passar a ModelTest-NG: “If you are still using jModelTest, please consider switching to ModelTest-NG.” (no l'instal·laré a no ser que algun usuari m'ho demaneu explícitament).

Per fer servir jModelTest:

#!/bin/bash

java -Xmx20G -jar /home/soft/jModelTest-2.1.4/jModelTest.jar  etc // he ficat 20G de RAM però podrien ser 
                                                                  // molt més, depén del treball

Actualització 2 d'octubre de 2024. Actualitzo el programa a la seva darrera versió (2.1.10), tant a /home/soft com a dins dels nodes. Es pot fer servir amb les comandes:

// En el cas de fer servir jModelTest de /home/soft
java -Xmx10G -jar /home/soft/jmodeltest-2.1.10/jModelTest.jar etc


// En el cas de fer servir el jModelTest dels nodes
$ java -Xmx10G -jar /usr/share/jmodeltest/jModelTest.jar etc