“A flexible read trimming tool for Illumina NGS data”

Pàgina web

Manual en pdf (v0.32)

github

Programa amb mil opcions, dependències (jellyfish?) etc. Per començar a operar amb ell per enviar un treball:

#!/bin/bash

java -Xmx25G -jar /home/soft/Trimmomatic-0.39/trimmomatic-0.39.jar  etc etc

(A l'exemple com podeu veure, li he ficat 25G de RAM de prova, paràmetre a gust del consumidor)