SINA

“Reference based multiple sequence alignment

SINA allows incorporating additional sequences into an existing multiple sequence alignment (MSA) without modifying the original alignment.”

Pàgina web

Github del projecte

La última versió instal·lada al cluster és la 1.7.2. Hi ha una altra versió més actual encara (1.7.3-dev) que no instal·laré a no ser que me la demani un usuari.

Per fer-la servir al cluster:

#!/bin/bash

export PATH=/home/soft/sina-1.7.2-linux/bin/:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/soft/sina-1.7.2-linux/lib/:$LD_LIBRARY_PATH

sina etc etc