Computational Biology Lab Wiki

This page is read only. You can view the source, but not change it. Ask your administrator if you think this is wrong.
# BIMr

*"A new Bayesian method to identify the environmental factors that influence recent migration. BIMr is a free software that makes inferences about recent proportions of immigrant genes in subdivided populations and that identifies the environmental factors that are responsible for observed gene flow patterns."*

Bé, en tot cas no tant new. Programa no tinc clar si **del 2007 o del 2008** (!), **de 32 bits** (!!) (per tant que només es menjarà en principi 4G màxims de RAM). Per si fos poc encara, que treballa a nivell gràfic amb llibreries gràfiques absolutament deprecated en qualsevol distribució moderna. 

[Pàgina del programa](https://leca.osug.fr/-Genomique-des-populations-)?

[Manual en pdf del programa](https://leca.osug.fr/IMG/pdf/documentation_of_bimr.pdf)

No he trobat cap repositori a github, i m'estranyaria...

En principi per poder treballar-hi, heu en primer lloc de [mirar de connectar-vos via túnel sshvnc a una sessió gràfica prèviament iniciada al node al que treballareu](https://tic.ceab.csic.es/cblabdoc/doku.php?id=users:guides:graphical_access).

Posteriorment si feu dins d'aquesta sessió gràfica i obrint una terminal:

```
export PATH=/home/soft/BIMr-i686/bin/:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/soft/BIMr-i686/bin/:$LD_LIBRARY_PATH
cd /home/soft/BIMr-i686/bin
./BIMr
```

se us hauria d'obrir (encara)(Ubuntu 20.04). Sembla que us hauria de permetre operar. En principi perquè gràficament les QT aquestes del Cretàcic i de 32 bits dibuixen les finestres molt d'aquella manera...