Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- users:catalogue:programs:jmodeltest [2024/06/13 09:27] – created admins_ceab
+++ users:catalogue:programs:jmodeltest [2024/10/02 10:16] (current) – admins_ceab
@@ Line 3: / Line 3: @@
 *"jModelTest is a tool to carry out statistical selection of best-fit models of nucleotide substitution. It implements five different model selection strategies: hierarchical and dynamical likelihood ratio tests (hLRT and dLRT), Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC), and a decision theory method (DT)."*
+[Github del programa](https://github.com/ddarriba/jmodeltest2/tree/master)
+[Darreres versions del programa](https://github.com/ddarriba/jmodeltest2/files/7229476/manual.pdf) (...del 2016)
+[Manual en pdf de les darreres versions](https://github.com/ddarriba/jmodeltest2/files/7229476/manual.pdf)
+Ells mateixos en el seu fòrum d'ajuda recomanen de passar a ModelTest-NG: *"If you are still using jModelTest, please consider switching to [ModelTest-NG](https://github.com/ddarriba/modeltest/tree/master)."* (no l'instal·laré a no ser que algun usuari m'ho demaneu explícitament).
+Per fer servir jModelTest:
+```
+#!/bin/bash
+java -Xmx20G -jar /home/soft/jModelTest-2.1.4/jModelTest.jar  etc // he ficat 20G de RAM però podrien ser
+                                                                  // molt més, depén del treball
+```
+**Actualització 2 d'octubre de 2024**. Actualitzo el programa a la seva darrera versió (2.1.10), tant a /home/soft com a dins dels nodes. Es pot fer servir amb les comandes:
+```
+// En el cas de fer servir jModelTest de /home/soft
+java -Xmx10G -jar /home/soft/jmodeltest-2.1.10/jModelTest.jar etc
+// En el cas de fer servir el jModelTest dels nodes
+$ java -Xmx10G -jar /usr/share/jmodeltest/jModelTest.jar etc
+```